新冠肺炎、流感、SARS都是由病毒侵襲人類引起的疾病，中醫學稱之為瘟疫，我國有2000多年防治瘟疫的經驗。近年來，隨著醫學界的深入研究，中藥的廣譜抗病毒作用得到了科學證實。連花清瘟防治新冠肺炎、流感等傳染性疫病的良好療效是由其深厚的中醫理論根基、翔實的科學證據、廣譜抗病毒的特性所決定的，是我國中醫藥抗疫劃時代的重大成果。
連花清瘟是匯聚三朝名方，創造性融合為一個創新藥物，它可以發揮衛氣同治，表里雙解；先證用藥，截斷病勢；整體調節，多靶治療等作用。
該藥運用中醫絡病理論探討外感溫病及瘟疫傳變的規律及治療，融匯漢代張仲景《傷寒論》中專治疫病的麻杏石甘湯、清代吳鞠通《溫病條辨》中專治疫病的銀翹散化裁和明代吳又可《溫疫論》治疫證用大黃經驗，是三朝名醫治療疫證的用藥精華，對疫病發熱、咳嗽、喘促用藥，具有良好的退熱、止咳、抗炎、抗病毒作用。組方中添加的紅景天，可以提高人體抗疲勞、耐缺氧能力，應對新冠肺炎普遍表現的乏力、氣短、血氧含量低造成的多臟器損害，提高抗病能力與康復能力。這在現代其他治療外感熱病，如感冒、流感、新冠的中成藥中是沒有的。
近年來，針對新冠病毒、甲型H1N1流感病毒、SARS病毒等傳染性強的病毒，連花清瘟開展了系統性的實驗與臨床研究，通過系列科學研究證實其良好確切的廣譜抗病毒作用，起點高，應用面廣。
2003年SARS疫情肆虐，中國軍事醫學科學院P3實驗室研究發現，連花清瘟可有效抑制SARS病毒。2009年甲型H1N1流感大流行，首都醫科大學附屬北京佑安醫院聯合九家甲型流感收治醫院，開展了“連花清瘟治療甲型H1N1流行性感冒”的循證醫學研究，結果顯示連花清瘟在抗病毒作用方面與奧司他韋沒有差異，在緩解流感癥狀方面優于奧司他韋。
自2019年底新冠肺炎發生以來，國內很多科研院所開展了一系列連花清瘟防治新冠肺炎、預防轉重癥方面的基礎和臨床研究。廣州呼吸健康研究院、呼吸疾病國家重點實驗室在國際藥理學界主流期刊《藥理學研究》發表的《連花清瘟對新冠病毒具有抗病毒、抗炎作用》研究證實，連花清瘟通過抑制病毒復制、抑制宿主細胞炎癥因子表達，從而發揮抗新冠病毒活性的作用。最新研究還發現，無論是對Alpha、Beta，還是Delta等變異株，連花清瘟都顯示了穩定的體外抗病毒作用。
論文《連花清瘟對新型冠狀病毒具有抗病毒、抗炎作用》被國際期刊《藥理學研究》評選為2019-2020年度全球優秀論文獎
發表在歐洲權威雜志《植物醫學》的“中藥連花清瘟膠囊治療新型冠狀病毒肺炎前瞻性、隨機、對照、多中心臨床研究”結果顯示，在常規治療基礎上聯合應用連花清瘟口服14天可顯著提高新冠肺炎發熱、乏力、咳嗽等臨床癥狀的改善率，明顯改善肺部影像學病變，縮短癥狀持續時間，提高臨床治愈率，縮短核酸轉陰時間，遏制新冠病情惡化，在減少轉重型比例方面顯示出良好趨勢。
近期，由一篇“連花清瘟預防新型冠狀病毒肺炎”研究論文被國際學術期刊《循證補充和替代醫學》刊發，從真實世界研究角度證明了新冠密切接觸者使用連花清瘟可有效降低核酸檢測陽性率和發熱癥狀的發生率，并具有良好的安全性。最近天津散發疫情時，有關專家指出，連花清瘟對于奧密克戎變異株的治療同樣取得了良好效果，獲得了寶貴的臨床應用經驗，并建議推廣應用于奧密克戎的疫情防控中。
連花清瘟是“三方三藥”應用最廣的藥物。新冠肺炎疫情發生以來，先后被國家衛健委和國家中醫藥管理局聯合發布的《新型冠狀病毒肺炎診療方案》（試行第四/五/六/七/八版）及20余個省市的新冠肺炎診療方案推薦，2020年4月國家藥品監督管理局批準連花清瘟用于“新型冠狀病毒肺炎輕型、普通型”的治療。2020年疫情期間，湖北省、黑龍江省等多省市將連花清瘟作為儲備用藥，國家工業和信息化部將其列為疫情防控重點保障物資。
連花清瘟不僅在國內抗疫中發揮了重要作用，而且為海外抗疫提供了中國方案，獲得了海外的一致贊譽。截至目前，連花清瘟已在巴西、菲律賓、印度尼西亞、加拿大、柬埔寨等近三十個國家和地區獲準上市，是中藥進入國際抗疫前線的有效藥物。
